Thu thập các tế bào gốc tạo máu để cấy ghép.
Rút tủy xương.
Dù là phẫu thuật cấy ghép tự thân hay dị thân thì phương pháp lấy máu từ tủy cũng tương tự nhau, và thường được thực hiện trong trạng thái đã gây mê toàn thân trong phòng phẫu thuật, để tránh cảm giác đau của vết thương. Sử dụng một đầu kim chuyên dùng để rút máu đưa vào tủy xương mào chậu của bệnh nhân, sau đó lấy ra dịch tủy xương màu đỏ đặc. Lượng tủy lấy ra tùy thuộc vào trọng lượng cơ thể bệnh nhân, cũng như nồng độ các tế bào gốc trong tủy xương hiến tặng, vào khoảng 2-5% lượng tủy của người hiến tặng, người hiến tặng sẽ cần khoảng 3-4 tuần để hồi phục. Quá trình lấy tủy không yêu cầu phải phẫu thuật rạch và khâu da, chỉ để lại một số lỗ nhỏ trên bề mặt da. Người hiến tặng sau khi hết thuốc mê, sẽ có cảm giác khó chịu ở nơi bị lấy tủy, nhưng người hiến có thể dùng thuốc giảm đau loại thường để kiểm soát đau, một hai ngày sau là có thể xuất viện và từ từ trở lại hoạt động bình thường.
Lấy tế bào gốc tạo máu ngoại biên.
Trong điều kiện sinh lý bình thường, máu chỉ chứa một lượng rất nhỏ tế bào tạo máu, không thể cung cấp theo như mong muốn cho việc cấy ghép. Vì vậy cần phải có những cơ chế xử lý đặc biệt, cần phải đưa tế bào gốc tạo máu trong tủy xương vào trong máu ngoại biên. Thông thường cứ hai lần mỗi ngày bạch cầu ở dưới da sẽ sản sinh ra hormone tăng trưởng (RhG-CSF). Đến ngày thứ 4 hay thứ 5 thì sẽ thông qua nội tĩnh mạch để vào catheter 2 lòng, từ đó thông qua cơ chế phân tách tế bào để thu thập các tế bào gốc, quá trình thu thập tế bào thường từ 1-2 ngày, mỗi ngày khoảng 4 tiếng. Người hiến tặng có thể nằm trên giường bệnh đọc sách ăn uống nghỉ ngơi, và cũng không phải chịu đau đớn như trong quá trình sau khi gây mê để rút tủy, sau khi xuất viện là có thể làm việc bình thường. Vì vậy phương pháp này đang được đón nhận rộng rãi thời gian gần đây.
Lấy tế bào gốc tạo máu từ cuống rốn.
Khi thai nhi được sinh ra, từ nhau thai có thể phân tách ra được khoảng 40 đến 100cc máu, thêm vào chất chống đông máu, rồi dùng ni tơ lỏng ở nhiệt độ cực thấp để đông lại để bảo quản sau này có người thích hợp thì có thể dùng để cấy ghép tế bào máu.
Những chuẩn bị trước phẫu thuật cấy ghép.
Đầu tiên, bệnh nhân phải có đủ nền tảng thể lực, mới có thể chịu được thách thức nặng nề của phẫu thuật cấy ghép tế bào gốc. Tuổi tác, tình trạng cơ thể, chức năng của các cơ quan, chẩn đoán và thời kỳ của căn bệnh đều là những yếu tố cần phải được xem xét tới. Trước khi cấy ghép, cần phải thực hiện kiểm tra và đánh giá tổng quát tình trạng cơ bản của bệnh nhân, bao gồm cả tim, phổi, gan, thận và các cơ quan khác. Ngoài ra để chuẩn bị cho việc cấy ghép, đội ngũ y tế cần phải sắp xếp một đến nhiều lần trao đổi, đánh giá tâm lý với bệnh nhân và gia đình, để biết được mức độ hiểu biết cũng như sự chuẩn bị của bệnh nhân và gia đình đối với việc cấy ghép, đặc biệt là vai trò của gia đình cũng như hệ thống hỗ trợ, cũng như cung cấp các tài liệu tham khảo về việc cấy ghép. Đồng thời cung cấp cho bệnh nhân và gia đình nhiều nguồn lực, để giảm các yếu tố tâm lý có thể làm ảnh hưởng đến việc cấy ghép.
Phác đồ điều hòa trước khi tiến hành cấy ghép.
Khi bệnh nhân bước vào phòng bệnh cấy ghép tế bào gốc tạo máu, đầu tiên phải trải qua điều trị hóa trị liều cao trong vài ngày hoặc kết hợp với điều trị chiếu xạ toàn thân. Thông qua thiêu đốt phần tủy, hệ thống miễn dịch và tế bào ung thư, sẽ tạo ra không gian trống cho tủy và các tế bào gốc mới. Đây được gọi là phác đồ điều hòa (Conditioning regimen), cũng có người gọi đây là phác đồ chuẩn bị (Preparative regimen). Trước khi thực hiện phác đồ điều hòa, trước tiên cần phải đặt ống thông tĩnh mạch vào tâm nhĩ phải, để có thể thông qua đó cung cấp một đường để đưa thuốc, chất dinh dưỡng tĩnh mạch, truyền máu và lấy máu. Trong thời gian thực hiện phác đồ điều hòa, bệnh nhân thường cảm thấy yếu người, lo âu, buồn nôn và ói mửa. Những lúc này cần cung cấp cho bệnh nhân thuốc chống nôn dự phòng và các thuốc điều hòa tâm trạng, giúp giảm thiểu những khó chịu trong quá trình điều trị. Khoảng 1-2 ngày sau khi kết thúc phác đồ điều hòa, là có thể tiến hành cấy ghép tế bào gốc. Việc truyền tủy và máu chứa tế bào gốc tạo máu cũng tương tự nhau, chỉ cần đưa qua đường tiêm tĩnh mạch, không cần phải tiến hành trong phòng mổ.